Description
Chef de projet: Duccio Cavalieri
Institution d'accueil: Fondazione E. Mach
Durée: du 01/12/2012 au 30/11/2014
Coût total supporté par la PAT : 200 000,00
Domaine scientifique ou technologique: Agroalimentaire
Sujets impliqués:
- Coordinateur FEM-CRI
Responsable scientifique : Duccio Cavalieri
Collaborateurs : Anja Zimmermann, Alessandro Cestaro, Tobias Weil, Fulvio Mattivi, Kieran Tuohy, Carlotta De Filippo, Claudio Donati. - Partenaires FBK
Responsable scientifique : Cesare Furlanello - Partenaire CIBIO-UNITN
Responsable scientifique : Olivier Jousson
Collaborateurs : Olivier Jousson, Nicola Segata - UO Dietetics and Clinical Nutrition, APSS : Partenaire
Responsable scientifique : Carlo Pedrolli - UNIFARM : Partenaire
Responsable scientifique : Paolo Zanini
Objectifs du projet
METAFOODLABS est une initiative dédiée à l'étude de l'interaction entre le système immunitaire, les micro-organismes environnementaux et intestinaux et le régime alimentaire. Son objectif est de trouver des indications possibles sur le flux de micro-organismes de l'environnement vers l'homme et le traitement, avec le soutien des structures de soins du Trentin, des patients atteints de maladies inflammatoires, dont l'incidence augmente dans le monde globalisé, tant en termes d'impact sur la population qu'en termes de coûts thérapeutiques et de qualité de vie. Il vise également à permettre le développement d'une recherche innovante sur le rôle des aliments fermentés traditionnels en tant que source de micro-organismes probiotiques utiles au maintien d'un système immunitaire sain, en explorant la possibilité de caractériser les micro-organismes présents dans les produits typiques du Trentin-Haut-Adige pour le développement industriel de nouveaux aliments fonctionnels. Les résultats attendus de la recherche ont été publiés ou sont en cours de publication dans des revues scientifiques internationales.
État de la technique et solutions au problème/solutions existant avant le projet, et améliorations apportées par le projet
Il existe un intérêt croissant pour l'utilisation de l'alimentation comme nouveau moyen de faire de la médecine personnalisée en agissant sur ce que l'on appelle la connexion intestin-environnement (nutrition, microbiote). Comprendre cette association signifie fournir un nouvel outil pour les thérapies basées sur l'alimentation. L'approche métagénomique permet de relier la structure et le fonctionnement des communautés microbiennes associées à la santé de l'hôte permettant le développement de nouveaux probiotiques et prébiotiques préventifs visant à maintenir la santé.
Organisation du travail :
L'équipe de travail a impliqué la contribution interdisciplinaire du personnel de FEM, FBK, CIBIO, APSS, UNIFARM.
Nous avons intégré des analyses métagénomiques utilisant le séquençage de nouvelle génération (NGS) et la microbiologie classique a été combinée avec des tests immunologiques et bioinformatiques.
Grâce à une participation financière d'Unifarm, un doctorat de recherche conjoint a été activé avec Cibio (2013-2016) (Prof. Jusson). De nouvelles entreprises du Trentin, telles que miRNA green, ont exprimé leur intérêt pour l'utilisation de l'infrastructure créée.
Résultats obtenus :
- Une infrastructure a été mise en place pour l'évaluation des propriétés pro- et anti-inflammatoires des communautés microbiennes.
- Nous avons découvert l'interaction entre les levures et les bactéries dans le Vino Santo, associée à la typicité du produit
- Nous avons évalué les effets de différents régimes alimentaires sur la composition du microbiote intestinal d'enfants atteints de la maladie de Crohn.
- Nous avons découvert comment les levures et les bactéries ainsi qu'une altération de l'axe intestin-cerveau provoquent des troubles inflammatoires chroniques et des troubles du développement neurologique.
Impact :
Les applications futures sont le développement de nouvelles approches thérapeutiques, basées sur les aliments fermentés et les micro-organismes bénéfiques. L'utilisation de l'infrastructure réalisée permettra l'évaluation systématique de la qualité immunomodulatrice de l'interaction aliment-microorganisme, contribuant à la connaissance des avantages possibles des produits alimentaires typiques, liés à la relation biologique avec le territoire, améliorant les chaînes d'approvisionnement locales du Trentin liées aux processus de fermentation.
Mots clés : interaction micro-organismes-environnement, régime alimentaire, interaction micro-organismes-hôte, métagénomique, probiotiques, typicité